Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ell2Q3UKU1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms