Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plxnd1Q3UH93 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms