Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zyg11bQ3UFS0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zyg11bQ3UFS0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms