Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Gtpbp6Q3U6U5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Gtpbp6Q3U6U5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms