Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenplQ3U3S3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms