Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kdm4dQ3U2K5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms