Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LcorlQ3U285 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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