Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms