Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms