Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp13a5Q3TYU2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms