Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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