Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarca4Q3TKT4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca4Q3TKT4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms