Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb38Q3LR78 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb38Q3LR78 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms