Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm1Q2TV84 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm1Q2TV84 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms