Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli2Q0VGT2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms