Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttc39dQ0VF76 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc39dQ0VF76 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Ttc39dQ0VF76 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ttc39dQ0VF76 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ttc39dQ0VF76 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttc39dQ0VF76 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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