Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rab42Q0PD08 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms