Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms