Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrioQ0KL02 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms