Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf541Q0GGX2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf541Q0GGX2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms