Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cass4Q08EC4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms