Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms