Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MestQ07646 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MestQ07646 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MestQ07646 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MestQ07646 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
MestQ07646 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms