Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms