Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nfe2Q07279 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms