Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gdf3Q07104 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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