Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms