Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp2Q06649 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms