Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cab39Q06138 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cab39Q06138 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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