Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Caprin2Q05A80 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Caprin2Q05A80 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms