Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprgQ05909 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprgQ05909 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms