Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk18Q04899 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms