Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl7Q03366 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl7Q03366 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms