Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms