Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdcd1Q02242 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms