Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nme2Q01768 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms