Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sec23aQ01405 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms