Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HmgcrQ01237 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms