Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grin2bQ01097 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin2bQ01097 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms