Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga4Q00651 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga4Q00651 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms