Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx2Q00262 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms