Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata5P97489 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata5P97489 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms