Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smyd1P97443 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms