Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LystP97412 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LystP97412 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LystP97412 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LystP97412 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LystP97412 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LystP97412 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LystP97412 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LystP97412 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LystP97412 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LystP97412 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms