Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmsP97355 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmsP97355 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SmsP97355 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SmsP97355 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SmsP97355 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SmsP97355 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SmsP97355 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SmsP97355 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SmsP97355 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SmsP97355 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms