Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8a1P70414 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8a1P70414 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms