Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf11P70378 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms