Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgif1P70284 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms