Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf6P70279 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf6P70279 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms