Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NficP70255 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NficP70255 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NficP70255 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NficP70255 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NficP70255 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NficP70255 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms